微生物のMALDI-TOF MS生データの提供
NITEで取得した微生物のMALDI-TOF MS生データの提供について紹介します。
MALDI-TOF MS生データの提供について
NBRCでは、MALDI-TOF MS(マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型質量分析計)微生物同定用ライブラリーを2017年12月から無償提供しています。このたび、ライブラリー作成のために取得した微生物のMALDIピークリスト/MALDI MSスペクトルデータ(以下、「生データ」と記載)の一部をDBRP(生物資源データプラットフォーム)からダウンロードいただけるサービスを開始しました。
対象の微生物グループは以下のとおりで、提供するデータの形式は、ブルカー(株)製の機器で測定したものはMSスペクトルデータ、(株)島津製作所製の機器で測定したものはテキストデータです。ぜひご活用ください。
黄麹菌類縁菌
菌株リスト:【供試菌株リストExcel】
データ入手先:黄麹菌類縁菌のデータに関するDBRPのリンク先
【プロジェクト(黄麹菌類縁菌_MALDIデータ(for Biotyper))】
【プロジェクト(黄麹菌類縁菌_MALDIデータ(for SARAMIS))】
本データのダウンロードには、以下の注意事項に同意することが必要です。
Lactobacillus
菌株リスト:【供試菌株リストExcel】
データ入手先:Lactobacillusグループのデータに関するDBRPリンク
【プロジェクト(Lactobacillus_MALDIデータ(for Biotyper))】
【プロジェクト(Lactobacillus_MALDIデータ(for SARAMIS))】
本データのダウンロードには、以下の注意事項に同意することが必要です。
注意事項
1.MALDI-TOF MS微生物生データ(以下「本データ」という。)は独立行政法人製品技術評価技術基盤機構(以下「機構」という。)が取得したマススペクトルデータです。
2.本データは、生物資源データプラットフォーム(DBRP)における制限公開データであり、閲覧にはアカウントが必要です。アカウントの発行、データ閲覧をご希望の場合は、下記URL記載の「制限公開データ閲覧手順」を参考に必要書類をご作成いただき、[email protected]までご連絡ください。
https://www.nite.go.jp/nbrc/genome/db/dbrp_howtoaccess.html
3.本データの取扱いについては、原則として、DBRP利用規約に準ずるものとします。データの利用にあたっては、2.アカウント発行申請時に、同意書への同意に加えてデータの使用目的を添えて機構に申請してください。また、申請時に記載したデータ使用目的と異なる利用をご希望の場合には、別途機構に連絡し、許諾を得てください。
4.本データは、データ内に記載した学名情報について保証するものではありません。
5.本データのダウンロードにあたってご提供いただいた個人情報は、機構の情報セキュリティポリシー及び個人情報保護管理規程を遵守して取り扱います。
提供いただいた個人情報をもとに、機構のサービス向上のためヒアリング等にご協力をお願いすることがございますのであらかじめご了承ください。
6.本データのダウンロードには、上記1.~5.の注意事項、DBRP利用規約に同意することが必要です。
お問い合わせ
- 独立行政法人製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター バイオ技術評価・開発課(かずさ)
-
TEL:0438-20-5764
住所:〒292-0818 千葉県木更津市かずさ鎌足2-5-8 地図
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